MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD73 plasmid pHT7

Total Repeats: 83

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020243	T	6	6	223	228	0 %	100 %	0 %	0 %	449086548
2	NC_020243	TA	3	6	254	259	50 %	50 %	0 %	0 %	449086548
3	NC_020243	TAAA	2	8	352	359	75 %	25 %	0 %	0 %	449086548
4	NC_020243	TTC	2	6	834	839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449086549
5	NC_020243	T	6	6	879	884	0 %	100 %	0 %	0 %	449086549
6	NC_020243	TCA	2	6	909	914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086550
7	NC_020243	TAA	2	6	1014	1019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449086550
8	NC_020243	T	6	6	1070	1075	0 %	100 %	0 %	0 %	449086550
9	NC_020243	AATT	2	8	1106	1113	50 %	50 %	0 %	0 %	449086550
10	NC_020243	TAAA	2	8	1130	1137	75 %	25 %	0 %	0 %	449086550
11	NC_020243	TTC	2	6	1298	1303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449086550
12	NC_020243	T	7	7	1338	1344	0 %	100 %	0 %	0 %	449086550
13	NC_020243	ATA	2	6	1427	1432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449086550
14	NC_020243	TGT	2	6	1447	1452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449086550
15	NC_020243	TGA	2	6	1468	1473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449086550
16	NC_020243	AAT	2	6	1548	1553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449086550
17	NC_020243	TTA	2	6	1554	1559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449086550
18	NC_020243	TTA	2	6	1566	1571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449086550
19	NC_020243	AAGAA	2	10	1629	1638	80 %	0 %	20 %	0 %	449086550
20	NC_020243	CTTT	2	8	1642	1649	0 %	75 %	0 %	25 %	449086550
21	NC_020243	CAT	2	6	1670	1675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086550
22	NC_020243	TTTCTT	2	12	1763	1774	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	449086550
23	NC_020243	TC	3	6	1827	1832	0 %	50 %	0 %	50 %	449086550
24	NC_020243	CTCA	2	8	1838	1845	25 %	25 %	0 %	50 %	449086550
25	NC_020243	TCT	2	6	1849	1854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449086550
26	NC_020243	AT	3	6	1942	1947	50 %	50 %	0 %	0 %	449086550
27	NC_020243	A	6	6	1968	1973	100 %	0 %	0 %	0 %	449086550
28	NC_020243	TCCT	2	8	2003	2010	0 %	50 %	0 %	50 %	449086550
29	NC_020243	CCG	2	6	2056	2061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449086550
30	NC_020243	AAAG	2	8	2159	2166	75 %	0 %	25 %	0 %	449086551
31	NC_020243	A	7	7	2201	2207	100 %	0 %	0 %	0 %	449086551
32	NC_020243	T	6	6	2239	2244	0 %	100 %	0 %	0 %	449086551
33	NC_020243	ATT	2	6	2260	2265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449086551
34	NC_020243	TC	3	6	2270	2275	0 %	50 %	0 %	50 %	449086551
35	NC_020243	AAC	2	6	2309	2314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449086551
36	NC_020243	AT	3	6	2368	2373	50 %	50 %	0 %	0 %	449086551
37	NC_020243	A	6	6	2402	2407	100 %	0 %	0 %	0 %	449086551
38	NC_020243	CTAA	2	8	2607	2614	50 %	25 %	0 %	25 %	449086552
39	NC_020243	ATA	3	9	2620	2628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449086552
40	NC_020243	ACA	2	6	2643	2648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449086552
41	NC_020243	AAG	2	6	2665	2670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449086552
42	NC_020243	A	6	6	2675	2680	100 %	0 %	0 %	0 %	449086552
43	NC_020243	CAAA	3	12	2688	2699	75 %	0 %	0 %	25 %	449086552
44	NC_020243	TA	3	6	2718	2723	50 %	50 %	0 %	0 %	449086552
45	NC_020243	ATT	2	6	3691	3696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449086553
46	NC_020243	ACA	2	6	3720	3725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449086553
47	NC_020243	TCAT	2	8	3729	3736	25 %	50 %	0 %	25 %	449086553
48	NC_020243	TCAT	2	8	3792	3799	25 %	50 %	0 %	25 %	449086553
49	NC_020243	ATC	2	6	3851	3856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086553
50	NC_020243	ATT	2	6	3905	3910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449086553
51	NC_020243	TC	3	6	4008	4013	0 %	50 %	0 %	50 %	449086554
52	NC_020243	CTT	2	6	4042	4047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449086554
53	NC_020243	TGT	2	6	4069	4074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449086554
54	NC_020243	TTGT	2	8	4086	4093	0 %	75 %	25 %	0 %	449086554
55	NC_020243	TCA	3	9	4123	4131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086554
56	NC_020243	CTTC	2	8	4277	4284	0 %	50 %	0 %	50 %	449086554
57	NC_020243	TC	3	6	4295	4300	0 %	50 %	0 %	50 %	449086554
58	NC_020243	A	6	6	4327	4332	100 %	0 %	0 %	0 %	449086554
59	NC_020243	TA	3	6	4343	4348	50 %	50 %	0 %	0 %	449086554
60	NC_020243	ATC	2	6	4350	4355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086554
61	NC_020243	AATCTT	2	12	4368	4379	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	449086554
62	NC_020243	AGA	2	6	4419	4424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449086554
63	NC_020243	TCT	2	6	4453	4458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449086554
64	NC_020243	GAC	2	6	4562	4567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449086554
65	NC_020243	TTTC	2	8	4574	4581	0 %	75 %	0 %	25 %	449086554
66	NC_020243	TTG	2	6	4608	4613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449086554
67	NC_020243	A	6	6	4749	4754	100 %	0 %	0 %	0 %	449086554
68	NC_020243	GTTTTT	2	12	4769	4780	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	449086554
69	NC_020243	T	6	6	4817	4822	0 %	100 %	0 %	0 %	449086554
70	NC_020243	TTCTC	2	10	4852	4861	0 %	60 %	0 %	40 %	449086554
71	NC_020243	A	6	6	4876	4881	100 %	0 %	0 %	0 %	449086554
72	NC_020243	AAC	2	6	4964	4969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449086554
73	NC_020243	ACA	2	6	4972	4977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449086554
74	NC_020243	ACA	2	6	5005	5010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449086554
75	NC_020243	TGAA	2	8	5029	5036	50 %	25 %	25 %	0 %	449086554
76	NC_020243	CTTTT	2	10	5051	5060	0 %	80 %	0 %	20 %	449086554
77	NC_020243	CGTT	2	8	5088	5095	0 %	50 %	25 %	25 %	449086554
78	NC_020243	AAT	2	6	5100	5105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449086554
79	NC_020243	CTTT	2	8	5122	5129	0 %	75 %	0 %	25 %	449086554
80	NC_020243	CTT	2	6	5222	5227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449086554
81	NC_020243	ACT	2	6	5664	5669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086555
82	NC_020243	T	7	7	5685	5691	0 %	100 %	0 %	0 %	449086555
83	NC_020243	ATTC	2	8	5816	5823	25 %	50 %	0 %	25 %	449086555

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.